Dans un monde où 80 % de la population mondiale possède des super-pouvoirs, ici nommés « Alters », n'importe qui peut devenir un héros ou, s'il le souhaite, un criminel. Le manga suit les aventures de Izuku Midoriya « Deku », l'un des rares humains ne possédant pas d'Alter, qui rêve pourtant de rejoindre la filière super-héroïque de la grande académie Yuei et de devenir un jour un des plus grands héros de son époque, à l'image de son héros, All Might. Un jour, il a la chance de rencontrer son idole et celui-ci va lui donner une chose dont il ne croyait jamais pouvoir bénéficier.