Les tortues sont acculées par le gang des Dragons Pourpres et une bagarre éclate. Après que les tortues aient vaincu le gang des Dragons Pourpres, elles échappent à la police en entrant dans les égouts.
Maître Splinter raconte aux tortues pour la première fois leurs origines et demande aux tortues de tuer Shredder.
Raphael s'introduit dans le repaire du Foot, combat quelques gardes et laisse une note pour Shredder. La note demande à Shredder de rencontrer les quatre disciples de Splinter et de se battre jusqu'à la mort.

Cette série compte 62 numéros publiés par Mirage Studios entre mai 1984 et août 1993.