L'histoire débute avec Glass Heart, une jeune fille de 15 ans, formée par la mafia taiwanaise pour être une machine à tuer. Suite à l'assassinat d'un père devant sa fille, elle décide de mettre fin à ses jours. Dans le même temps, le couple Ryo et Kaori devait se marier, mais malheureusement pour eux, Kaori décède dans un accident de voiture. Son coeur pouvant sauver la vie de quelqu'un d'autre, il est acheminé pour une transplantation. Mais son coeur sera, en chemin, volé par la mafia taiwanaise afin que Glass Heart puisse de nouveau vivre. Celle-ci se réveillera un an plus tard, mais étrangement, elle va ressentir tous les souvenirs et les sentiments affectifs de Kaori. Elle décidera alors de partir à la recherche de Ryo, l'homme de ses pensées, en semant une certaine pagaille sur son passage...